Ascalaph Designer

Опис

Ascalaph Designer е програма за општа намена за молекуларни динамички симулации. Под една графичка средина се претставени како сопствена имплементација на молекуларната динамика, како и методите на класичната и квантната механика на популарните програми. Карактеристиките вклучуваат молекуларна графика: повеќе прозорци, две камери по модел, CPK, Wire frame, Stick, Ball and Stick и CPK Wire frame styles, изградба на молекуларни модели: градител на кристали, градител на синџири, цртање со глувче, уредување на молекуларна геометрија, прелиминарна оптимизација , квантна оптимизација и отстранување судири, оптимизација на молекуларна геометрија со методи на конјугирани градиент, молекуларна динамика: интеграција со повеќе временски чекори, интеграција од четврти ред, пресметки на суперкомпјутер со помош на MDynaMix, флексибилен SPC модел на вода и имплицитен воден модел и квантна хемикалија на CP2K и PC GAMESS/Firefly: енергија, оптимизација на молекуларната геометрија и потенцијални изведени полнежи.