GenoSuite

Опис

GenoSuite е рамка развиена за протеогеномска анализа. Стратегијата базирана на FDRScore се користи за интегрирање на резултатите од повеќе алгоритми за пребарување. Prokaryotic Proteogenomic Tool (PPT) е развиен како дел од рамката GenoSuite. PPT е за пронаоѓање нови преводи во прокариотски геноми и зависи од податоците за протеомика заснована на масовната спектрометрија и поврзаната геномска секвенца. Карактеристиките вклучуваат конфигуриран за 4 алгоритми со отворен код за да се изврши пребарување на базата на податоци за идентификација на пептиди и може да се избере која било комбинација од 4-те алгоритам, се наведуваат специфичните пептиди за пребарување на геномот (нови пептиди), спектралните совпаѓања може да се визуелизираат за проценка на квалитетот, се наведуваат може да се генерираат и нови протеини и промени во постојните протеински прибелешки, како и визуелен геномски контекст на новите пептиди.