CodonCode Aligner

Опис

CodonCode Aligner е софтвер лесен за корисникот за склопување на секвенци на ДНК, усогласување, контигно уредување и откривање мутации. Aligner е компатибилен со Phred-Phrap и целосно поддржува резултати за квалитет на секвенца, а истовремено нуди познат кориснички интерфејс кој е лесен за учење. Карактеристиките вклучуваат увезени секвенци од текстуални датотеки, порамнување на контиги едни со други додека ги чуваат врските до трагите, наоѓање хетерозиготни мутации, дефинирање региони на интерес („карактеристики“), увезување и уредување склопови генерирани од Phrap, извозни секвенци и карактеристики, увезени секвенци од датотеките ABI и SCF, векторски отсекување, порамнување на референтна секвенца, анализирање на хетерозиготни вметнувања и бришења, навигација помеѓу карактеристики дефинирани од корисникот и извоз на проекти за склопување компатибилни со Consed.